Schéma illustrant la structure hiérarchique 3D* de la chromatine. Le noyau est divisé en territoires occupés par des chromosomes seuls, qui ne se chevauchent ni ne s’entremêlent de manière significative, sauf pour ce qui est des associations compartimentales aux interfaces. Il existe deux compartiments actifs, le compartiment A et le compartiment B. Beaucoup de groupes d’interactions coexistent, distribués dans tout le noyau, où la chromatine appartenant à un même type de compartiment s’associe. Localement, la chromatine s’assemble en domaines d’association topologiques (TADS). Deux modèles différents de TAD sont décrits : ceux propres à la souris (haut) et ceux propres à Drosophila (bas). Les flèches oranges indiquent le mouvement de la cohésine pendant l’extrusion de boucle. Abréviations : CTCF : facteur de liaison au CCCTF ; RNA Pol II, ARN polymérase II.
La structure 3D* de la chromatine du noyau est importante pour la régulation de l’expression génique et le correct déploiement des programmes de développement. La différenciation des cellules germinales ainsi que le développement embryonnaire précoce (lorsque le génome zygotique est activé et que la transcription a lieu pour la première fois) sont accompagnés par des changements spectaculaires de l’expression des gènes et du paysage épigénétique. De récentes études ont fait usage de la High Chromosome Contact map (Hi C) afin de poursuivre des investigations sur l’organisation en 3D de la chromatine pendant les transitions développementales, découvrant le remarquable remodelage 3D du génome. Ici, nous soulignons les changements décrits jusqu’à présent et discutons certaines implications que ces découvertes ont sur notre compréhension des mécanismes et la fonctionnalité de l’architecture 3D de la chromatine. Clemens B. Hug and Juan M. Vaquerizas, et al, dans Trends in Genetics, publication en ligne en avant-première, 4 octobre 2018
*= tridimensionnelle
Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ