Des milliers de personnes ont été placées en détention, mais leur nombre exact varie selon les sources. Selon les estimations officielles, publiées par Associated Press en mars, au moins 16.000 personnes ont été placées en détention au cours de l’année passée dans le cadre de la répression généralisée menée contre les partisans de Mohamed Morsi et d’autres groupes et militants dissidents. Selon WikiThawra, une initiative du Centre égyptien pour les droits économiques et sociaux, au moins 80 personnes sont mortes en garde à vue depuis un an et plus de 40.000 ont été arrêtées ou inculpées entre juillet 2013 et la mi-mai 2014.
Les informations faisant état de torture et de disparitions forcées pendant la détention dans des locaux de la police ou de l’armée sont également très nombreuses.