Google rassemble la plus grande base de données au monde sur l'autisme

Autism Speaks, la plus importante fondation américaine de soutien à la recherche sur l’autisme, a annoncé mardi 10 juin entrer en partenariat avec Google afin de développer la plus grande base de données sur la génomique des personnes atteintes de troubles du spectre autistique.

Le géant du web va ainsi mettre à disposition sa plate-forme de cloud pour centraliser l'ensemble des données génétiques collectées auprès des personnes autistes et de leur famille. L'objectif est de créer la plus importante base de données au monde où seront centralisées toutes les informations génétiques concernant ces troubles du développement.

L’autisme est un trouble envahissant du développement qui apparaît précocement au cours de l’enfance et persiste à l’âge adulte. Il se manifeste par des altérations dans la capacité à établir des interactions sociales et à communiquer, ainsi que par des troubles du comportement. Les personnes souffrant d’autisme semble souvent isolées dans une sorte de monde intérieur. 
Les causes exactes de ces troubles du spectre autistique restent encore à découvrir. Toutefois, les recherches menées jusqu’à présent démontrent sans ambiguïté l’implication de facteurs génétiques.

Séquencer le génome de 10.000 individus

Le programme Autism Speaks Ten Thousand Genomes - qu’on peut plus simplement appeler AUT10K - devrait donc faciliter la collecte et l’analyse des échantillons d’ADN prélevé un peu partout dans le monde. Au final, il s’agit pour la recherche d’identifier les gènes en cause dans l’autisme et les troubles associés.

Comme son nom l’indique, le programme AUT10K a pour but de séquencer le génome de 10.000 individus autistes ou provenant de familles où des cas d’autisme ont été recensés.

C'est une transformation importante pour la recherche qui se heurte de plus en plus à la difficulté qu'il y a à traiter une somme de données qui ne cessent de croitre. L'information est là, mais conduire des études en génomique nécessite une puissance informatique dont ne dispose pas forcément les centres de recherche.

La plate-forme de séquençage génomique qui va être mise en place devrait permettre de considérablement accélérer le rythme des recherches.

"Le programme AUT10K a le potentiel pour radicalement transformer notre compréhension de l’autisme et redéfinir l’avenir des soins médicaux pour les personnes atteintes de ces troubles." explique Rob Ring, chef du département des sciences de la fondation Autism Speaks. Travailler avec Google va changer la donne", ajoute-t-il.

"La biologie moderne est devenue une science limitée par la masse de données qu'elle collecte. Les technologies informatiques modernes peuvent repousser ces limites", Explique David Glazer, ingénieur en chef de Google Genomics.

Précédemment, le transfert d'informations génomiques passait nécessairement par des disques durs. Mais la taille du génome entier d'un seul individu peut être de 100 gigabytes et son téléchargement peut prendre des heures. Le stockage surtout est un problème, un ordinateur même assez performant ne pouvant pas stocker plus de 10 génomes humains sur son disque dur.

Avec le cloud, les résultats de ces analyses génomiques seront obtenus "plus rapidement, et à moindre coût" selon David Glazer.

"Nous sommes très enthousiastes à l’idée de travailler avec l’équipe d’Autism Speaks sur le stockage, le traitement, l'exploration et le partage des données du programme AUT10K, et encore plus sur l’opportunité pour la plate-forme du cloud de Google d’aider à découvrir les causes de l'autisme et d'éventuels traitements."

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