L’histoire débute 4 ans après cet événement. C’est le retour de Kazuma ! Durant ce laps de temps, il s’est initié à l’art du vent (technique de Fu-jutsu). Sa maîtrise est telle qu’il est devenu un contractor (et de ce fait un Kaze no stigma). L’esprit du vent lui ayant confié le contrôle de l’air.
Suite à son retour, des morts mystérieuses surviennent parmi les membres du clan Kannagi. L’intrigue commence donc à se nouer. Une atmosphère de vengeance et de pouvoir se dévoile. Est-ce celle de Kazuma ? Ou bien, la réminiscence de haines issues du passé ? Ayano acquerra-t-elle le pouvoir suffisant pour devenir digne héritière du clan Kannagi ? Et quelle est cette mystérieuse détective enquêtant sur les phénomènes liés aux jutsu ?
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