Un secret vieux de plus de 50 ans est sur le point d’être dévoilé.
En effet, Jack Sylvane (Jeffrey Pierce), auteur-présumé d’un meurtre à San Francisco, attire l’attention du Détective Rebecca Madsen (Sarah Jones) alors qu’elle enquête sur lui.
Elle s’aperçoit que Sylvane n’est autre qu’un prisonnier d’Alactraz, qui avait mystérieusement disparu 50 ans auparavant.
Plus étrange encore, au cours de son enquête, elle va découvrir, avec l’aide d’un passionné de BD, le Dr Diego « Doc » Soto (Jorge Garcia, alias Hurley dans LOST), que Jack Sylvane n’était pas le seul à avoir disparu.
Une nuit, c’est en réalité tous les prisonniers quiavaient mystérieusement disparu, sans que les autorités puissent remettre la main
sur eux.
Croisant sur sa route l’énigmatique agent Emerson Hause (Sam Neill), Rebecca va alors découvrir que tous ces prisonniers sont sur le
point de faire leur retour.
Sans que ceux-ci n’aient pris une seule ride… Où étaient-ils ? Quel est leur secret ? Pourquoi ils reviennent maintenant ? Plus de 50 ans après sa fermeture, Alcatraz n’a pas fini de livrer tous ses secrets.