26 Mai 2010 à 08 h 53 Temps Universel, 17 h 53 heure locale à l'épicentre, un séisme sous marin de magnitude 6.4 a frappé à moins de 100 kilomètres au large de la côte Ouest-Sud-Ouest de l'Île japonaise de Minami Daito, la plus grande des îles Daito situé dans le district Shimajiri, Okinawa, dans la Mer des Philippines. Son épicentre, latitude 25.81° Nord et longitude 129.97° Est, se trouve à 101 kilomètres à l'Ouest-Sud-Ouest de Nishi, à 104 kilomètres l'Ouest-Sud-Ouest de Minadaito village, à 105 kilomètres à l'Ouest-Sud-Ouest de Kita, à 216 kilomètres au Sud-Est de Nago, à 226 kilomètres à l'Est d'Okinawa, à 235 kilomètres à l'Est de Naha, à 600 kilomètres à l'Est-Nord-Est de Ishigaki-jima et à 645 kilomètres au Sud de Kagoshima. Pour l'USGS, son hypocentre se situe à 10 kilomètres de profondeur mais pour le Centre Sismologique Euro-Méditerranéen, le CSEM, le séisme serait sub-affleurant et son foyer ne serait qu'à 2 kilomètres de profondeur.
Ce tremblement de terre de forte magnitude et de forte intensité, VIII sur l'échelle Medvedev-Sponheuer-Karnik, aussi appelée échelle MSK, fait suite à une crise sismique dont 5 secousses ont des magnitudes égales ou supérieures à 4,7 :
16 Mai 2010, magnitude 4.7, hypocentre 30 kilomètres de profondeur
16 Mai 2010, magnitude 5.3, hypocentre 28 kilomètres de profondeur
16 Mai 2010, magnitude 4.8, hypocentre 70 kilomètres de profondeur
16 Mai 2010, magnitude 4.7, hypocentre 40 kilomètres de profondeur
20 Mai 2010, magnitude 4.8, hypocentre 2 kilomètres de profondeur.
La secousse principale a été suivie, à 11 h 51 Temps Universel, 20 h 51 heure à l'épicentre, localisée latitude 25.75° Nord, longitude 130.11° Est, d'une réplique de magnitude 5.0 sur l'échelle ouverte de Richter.
L'Île est dans la zone subtropicale et, comme ses îles sœurs, Kita Daito et Oki Daito, elle a été formée à partir de récifs coralliens.
Le tremblement de terre s'est produit au cœur même de la Fosse de Ryukyu ou Fosse Nansei-Shoto, 1.200 kilomètres de longueur, profondeur maximale 7.460 mètres. Cette fosse se situe près de l’archipel des Ryukyu, se prolonge jusqu'à Taïwan et marque la frontière entre les plaques philippine et eurasiatique.
Le tsunami déclenché par le séisme a causé de nombreux dégâts et de probables victimes sur les îles de l'archipel corallien Daito