Project Origin pointe enfin le bout de son nez afin de se dévoiler une première fois avec quelques images relativement petites.
L’histoire de ce second volet vous placera dans la peau de Michael Becket, un militaire du groupe Delta, précédemment envoyé dans une ville dans l’optique de protéger une femme du nom de Genevieve Aristide.
Tout commence alors où vous vous rentrouvrez allongé, sur une table d'opération, dans un hôpital, les chirurgiens tentant tant bien que mal de vous ranimer. Après un très long coma de 28 jours, vous reprenez conscience et vous vous rendez compte que vous êtes dans un hôpital, désormais, totalement abandonné, mais surtout peuplé de créatures hostiles et mystérieuses.