Les appels à projets pour les équipements d’excellence devraient être lancés en premier, suivirent par ceux des laboratoires d’excellence, SATT, IRT et IHU et en dernier la ministre s’occupera des Campus d’excellence. Valérie Pécresse a affirmé : « Si chacun de ces appels à projet se conçoit de manière parfaitement autonome, ils n'en sont pas moins complémentaires. Un campus d'excellence doit évidemment comprendre à la fois des laboratoires d'excellence, mais aussi une société de valorisation et le potentiel d'un IRT ou d'un IHU ».
Elle a aussi indiqué que les dotations pour les campus et laboratoires d’excellence ne pourront pas être cumulées et que rien ne serait fait en dehors des établissements qui seront les porteurs de projets. Le calendrier exact et les modalités de sélections n’ont pas encore été dévoilés.