Interrogé sur les chambres à gaz,lors d'une conférence de presse à Lyon, le 11 octobre 2004, le député européen avait répondu: "Je ne nie pas les chambres à gaz homicides. Mais je ne suis pas spécialiste de cette question et je pense qu'il faut laisser les historiens en discuter. Et cette discussion devrait être libre". Professeur à l'université Lyon III, il a été suspendu pour 5 ans de ses fonctions d'enseignant-chercheur, en mars 2005. Poursuivi devant la justice lyonnaise, M. Gollnisch avait été condamné le 18 janvier 2007 par le tribunal correctionnel de Lyon à trois mois de prison avec sursis et 5.000 euros d'amende. Le 28 février 2008, la cour d'appel de Lyon avait confirmé ce jugement. M. Gollnisch avait alors formé un pourvoi en cassation.