La session de qualifications sur le circuit de Fuji Speedway s’est terminée avec quelques déceptions pour l’écurie Honda Racing F1 Team. Rubens Barrichello et Jenson Button partageront donc la neuvième ligne de la grille de départ demain lors du Grand Prix du Japon. Les conditions humides de la piste ont compliqué les préparations de l’équipe pendant la dernière session d'essais de ce matin. Hier, Jenson avait effectué des modifications dans les réglages de sa RA108 prévus pour une piste sèche sans pouvoir les essayer pour la session de qualifications de cet après-midi sec, ce qui lui a causé quelques problèmes.
Les deux pilotes ont réalisé d’excellents temps dès le début de la première qualification, avec 1:19.796 s pour Rubens et 1:20.293 s pour Jenson. Ils ont continué à faire une série de tours supplémentaires pour évaluer le comportement de leurs voitures, puis sont revenus aux stands pour ajouter d’autres réglages. Neuf minutes avant la fin des premières qualifications, ils ont repris la piste et ont montré des performances considérablement supérieures. Rubens a enregistré son meilleur temps à 1:18.882 s et Jenson à 1:19.100 s. À partir de ce moment-là, les deux pilotes étaient sûrs d’accéder aux deuxièmes qualifications. Vers la fin des premières qualifications, les pilotes ont choisi de nouveaux pneus et ont repris la piste pour le dernier tour. Leurs temps étaient bons sur les secteurs 1 et 2, mais ensuite au passage des virages du secteur 3, leurs pneus ne suivaient plus. Rubens a dû abandonner son tour, tandis que Jenson a franchi la ligne d’arrivée mais n’a pas enregistré de meilleur temps.