Développement au cours du temps - Analyse au niveau de la cellule unique - Transcriptomique Spatiale
STAR-FINDer: Analyse Spatio-Temporelle du Développement de l'Intestin chez le Foetus Humain
Le développement de l’intestin humain reste largement méconnu. Ici, nous établissons le lien entre le séquençage de l’ARN et la transcriptomique spatiale pour caractériser la morphogénèse intestinale avec le temps. Nous identifions 101 états cellulaires incluant des populations de cellules mésenchymateuses progénitrices ainsi que les programmes liés aux étapes morphogénétiques clés. Nous décrivons les principes de la formation de l’axe cryptes – villosités ; de la morphogénèse neurale, vasculaire, et mésenchymateuse, et de la population immunitaire de l’intestin en développement. Nous identifions les hiérarchies de différenciation des sous-types de fibroblastes en de myofibroblastes en développement et décrivons leurs diverses fonctions, en tant que cellules de niche vasculaires notamment. Nous précisons les origines des plaques de Peyer et celle du tissu lymphoïde associé à l’intestin (GALT) et décrivons les localisations spécifiques des différents profils immunitaires existants. Nous faisons usage de nos ressources pour présenter une analyse impartiale des gradients morphogénétique constituant la force motrice des oscillations séquentielles de différentiation cellulaire et définissons les cellules et les localisations liées aux troubles rares du développement intestinal. Nous réalisons des ressources en ligne accessibles au public, des analyses spatio-temporelles du développement de l’intestin chez le fœtus (STAR-FINDer), ouvrant ainsi la voie vers de futures recherches. David Fawkner-Corbett, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 5 janvier 2021
Source iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ
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